Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARCN1P48444 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms