Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5OP48047 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5OP48047 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5OP48047 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5OP48047 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms