Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP2P42575 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP2P42575 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP2P42575 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP2P42575 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP2P42575 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP2P42575 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP2P42575 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP2P42575 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP2P42575 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP2P42575 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP2P42575 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP2P42575 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP2P42575 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP2P42575 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP2P42575 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms