Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms