Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms