Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJC1P36383 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms