Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFNP31947 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFNP31947 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFNP31947 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFNP31947 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFNP31947 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFNP31947 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFNP31947 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFNP31947 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFNP31947 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFNP31947 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFNP31947 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFNP31947 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFNP31947 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFNP31947 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFNP31947 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFNP31947 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFNP31947 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFNP31947 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFNP31947 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFNP31947 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFNP31947 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFNP31947 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFNP31947 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFNP31947 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFNP31947 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFNP31947 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFNP31947 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFNP31947 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFNP31947 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFNP31947 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms