Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms