Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARID4AP29374 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms