Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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