Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms