Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms