Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms