Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms