Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BCKDHBP21953 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BCKDHBP21953 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BCKDHBP21953 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BCKDHBP21953 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BCKDHBP21953 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BCKDHBP21953 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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