Protein–RNA interactions for Protein: P18827

SDC1, Syndecan-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC1P18827 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDC1P18827 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDC1P18827 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDC1P18827 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDC1P18827 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDC1P18827 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDC1P18827 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDC1P18827 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDC1P18827 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDC1P18827 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDC1P18827 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDC1P18827 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDC1P18827 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDC1P18827 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDC1P18827 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDC1P18827 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDC1P18827 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDC1P18827 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDC1P18827 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDC1P18827 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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