Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms