Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RNF148-201ENST00000434824 1304 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AP003716.1-203ENST00000533670 613 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms