Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFTRP13569 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CFTRP13569 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFTRP13569 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFTRP13569 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFTRP13569 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFTRP13569 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CFTRP13569 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFTRP13569 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFTRP13569 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFTRP13569 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFTRP13569 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CFTRP13569 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CFTRP13569 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CFTRP13569 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CFTRP13569 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CFTRP13569 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms