Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms