Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DMDP11532 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DMDP11532 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
DMDP11532 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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