Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALM2P0DP24 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms