Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDN1P05305 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDN1P05305 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDN1P05305 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDN1P05305 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDN1P05305 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDN1P05305 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDN1P05305 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDN1P05305 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDN1P05305 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDN1P05305 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms