Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APODP05090 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms