Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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