Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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