Protein–RNA interactions for Protein: O60565

GREM1, Gremlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM1O60565 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREM1O60565 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREM1O60565 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREM1O60565 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms