Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EXTL3O43909 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms