Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms