Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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