Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms