Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms