Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms