Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E3Q9Y5X4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NR2E3Q9Y5X4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E3Q9Y5X4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms