Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAI2Q9Y5P3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms