Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN16Q9Y5I7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN16Q9Y5I7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN16Q9Y5I7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN16Q9Y5I7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms