Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF3AQ9Y496 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms