Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB1Q9Y478 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKAB1Q9Y478 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms