Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E1Q9Y466 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms