Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SBNO2Q9Y2G9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SBNO2Q9Y2G9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms