Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BTRCQ9Y297 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BTRCQ9Y297 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms