Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNNQ9UQP3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNNQ9UQP3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms