Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNRC6BQ9UPQ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms