Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM33Q9UPN9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms