Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CIZ1Q9ULV3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CIZ1Q9ULV3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIZ1Q9ULV3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms