Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
INO80Q9ULG1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
INO80Q9ULG1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
INO80Q9ULG1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms