Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA3Q9UL41 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PNMA3Q9UL41 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms