Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRDM4Q9UKN5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM4Q9UKN5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM4Q9UKN5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms