Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBD1Q9UJT1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBD1Q9UJT1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBD1Q9UJT1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBD1Q9UJT1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBD1Q9UJT1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBD1Q9UJT1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBD1Q9UJT1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBD1Q9UJT1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBD1Q9UJT1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBD1Q9UJT1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBD1Q9UJT1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBD1Q9UJT1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms