Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBE1Q9UJT0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms